Arch Linux Arm gibt es zumindest für PXA168 oder in allgemeiner From (jeweils ungetestet). Es funktionier aber wohl auch mit Android CupCake und Embedian Grip (Anleitung).
Es gibt einen “kexec bootloader”, der gefahrloses Experimentieren erlaubt: http://www.akshaal.info/2009/03/cebootlin-linux-autoloader-for-wince-on.html